Mimarlık Bölümü’nün tarihçesi 40 yıllık bir geçmişe dayanmaktadır. 1983 yılında Eskişehir'deki öğretim kurumlarının Anadolu Üniversitesi adı altında yapılandırılması sonucu, Mühendislik-Mimarlık Fakültesi bünyesinde kurulmuş ve 1984 yılında eğitime başlamıştır. 1993 yılında Anadolu Üniversitesi’nin bölünmesi sonucu, Anadolu Üniversitesi Yunus Emre Kampüsünde Mühendislik-Mimarlık Fakültesi bünyesinde yeniden yapılandırılarak 1994 yılında eğitime devam etmiştir. 1999 yılı Ekim ayında ise Anadolu Üniversitesi’nin İki Eylül Kampüsündeki binasına taşınmıştır. Bu sürecin devamında Mimarlık Bölümü, 14.11.2011 tarihinde, 2011/2471 sayılı Bakanlar Kurulu kararıyla Mühendislik-Mimarlık Fakültesi bünyesinden ayrılarak, yeni kurulan Mimarlık ve Tasarım Fakültesi içinde yer almıştır. Fakültede, Mimarlık Bölümünün yanı sıra 1991'den itibaren Güzel Sanatlar Fakültesi bünyesinde faaliyet gösteren İç Mimarlık Bölümü ile 1993'te kurulan Endüstriyel Sanatlar Yüksek Okulu bünyesindeki Endüstriyel Tasarım ve Moda Tasarımı Bölümleri yer almıştır.
Mimarlık Bölümü halen: 18 Mayıs 2018 tarihli ve 30425 sayılı Resmi Gazete’de yayımlanan 7141 Sayılı Kanun ile kurulan Eskişehir Teknik Üniversitesi bünyesinde, Mimarlık ve Tasarım Fakültesi çatısı altında eğitim ve öğretim faaliyetlerini İki Eylül Kampüsünde sürdürmektedir. Yeniden yapılanan Üniversitedeki gelişmelere bağlı olarak Mimarlık ve Tasarım Fakültesi, iki ayrı kampüste (Yunus Emre ve İki Eylül Kampüslerinde) 3 ayrı binada eğitim öğretim faaliyetlerini sürdürürken; Fakülteye İki Eylül Kampüsünde tahsis edilen ve diğer bölümlerle birlikte tek binada toplanılması planlana yeni binaya taşınma süreci, Mimarlık Bölümü için de başlamıştır. 2021-2022 akademik yılı bahar dönemi sonunda derslerin bitimiyle tüm dersliklerin, atölyelerin, ofislerin taşınması ve altyapının hazırlanması, 2022-2023 akademik yılı güz döneminden önce tamamlanmıştır. Bölüm 2022-2023 güz döneminden itibaren yeni binada ve tek gruplu yürütülen bazı dersler için eski binada mevcut bulunan büyük atölyelerinde eğitim öğretim faaliyetlerine devam etmektedir. Üniversite yönetimince 2023-2024 akademik yılı güz döneminden önce yeni binada ihtiyaç duyulan yüksek kapasiteli atölyelerin oluşturulması planlanmaktadır.
Mimarlık Bölümü, yeni bir binada, Fakültenin diğer bölümleri ile etkileşim içerisindedir. Üniversite ve Fakültenin vizyon ve misyonuna uyumlu biçimde yenilikçi, girişimci, araştırmacı, katılımcı, disiplinler arası iş birlikleri kurabilen, geleceğe yön verebilen, ulusal ve evrensel düzeyde fark yaratan çağdaş ve öncü bir bölüm olma amacını benimsemiştir.